Фамилия Мортова — женская форма фамилии Мортов, и её происхождение неочевидно на первый взгляд. В отличие от большинства русских фамилий на -ов, образованных от имён или профессий, здесь возможны сразу два пути, и ни один из них нельзя отбросить.

Первый и самый вероятный вариант — связь с прозвищем Морт. В старых русских говорах «морта» или «морт» могло означать «смерть», «мор». Такое прозвище давали человеку с мрачным нравом, бледным лицом или тому, кто пережил эпидемию. Фамилии от слова «мор» встречаются: Морозов, Мороз — от другого корня, но Мортов стоит в этом же ряду, хоть и реже. Суффикс -ов типичен для русских фамилий, указывает на принадлежность к главе семьи: Мортов — сын или потомок Морта.

Второй вариант — географический. В России есть река Морта (приток Вятки) и несколько деревень с названием Морты или Мортка. В таком случае фамилия могла возникнуть у выходца из этих мест: «Мортов» — тот, кто с Морты. Эта версия особенно правдоподобна для жителей Кировской области и Удмуртии, где топоним Морта встречается чаще всего.

Сложность в том, что слово «морт» в древнерусском языке имело ещё одно значение — «человек» (от финно-угорского «murt»). В северных говорах и в коми-пермяцком языке «морт» — это именно человек, мужчина. Если предки носили такое прозвище, оно могло означать просто «чужой», «инородец» или, наоборот, «настоящий мужик». Но эта гипотеза менее надёжна: в русской ономастике прямых заимствований из финно-угорских языков в фамилиях на -ов немного, они скорее исключение.

В документах фамилия Мортов (и Мортова) встречается с XVII века, в основном среди крестьян и посадских людей северных уездов. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. Таким образом, носительницы фамилии Мортова с наибольшей вероятностью происходят из крестьянской среды Русского Севера или Вятки, а их предок получил прозвище либо по характеру (мрачный, «смертный»), либо по месту жительства у реки Морты.