Фамилия Морженкова образована от мужского варианта Морженков. Основа здесь — прозвище Моржонок или Морженок, которое давали ребенку с крупным телосложением, неуклюжестью или, напротив, с детской привычкой много и сладко спать, подобно моржу. В русских говорах слово «морж» имело и переносное значение — так называли крепкого, коренастого человека, а также любителя поспать. Уменьшительный суффикс -онок/-енок в прозвище указывает на младшего родственника или на ребенка, который напоминал взрослого моржа. Позже от этого прозвища через патронимический суффикс -ов (чей? — Морженков) и возникла фамилия.

Женская форма Морженкова — это не отдельная фамилия, а грамматическое изменение мужской: так в русской традиции называли жену или дочь Морженкова. Суффикс -ов здесь типичен для центральных и северных регионов России, где фамилии на -ов и -ев распространены повсеместно. Географически фамилия чаще всего встречается в Тверской, Псковской и Новгородской областях — в зоне бытования северных говоров, где слово «морж» было в ходу и в прямом, и в переносном смысле.

В ономастике есть и альтернативная версия: основа могла восходить к древнерусскому нецерковному имени Морж, которое давали по тотемическому принципу, но она менее убедительна, так как имя Морж не зафиксировано в исторических источниках как распространенное. Прозвище же, напротив, логично и объяснимо. Таким образом, носительницы фамилии Морженкова — потомки человека, которого в деревне прозвали Моржонком за внешность или повадки. Фамилия не дворянская, а крестьянская или мещанская, что типично для большинства русских фамилий на -ов.