Фамилия Моруженков — одна из тех, где за привычным суффиксом скрывается неочевидная основа. Она явно образована от прозвища или мирского имени, но с какой именно исторической лексикой мы имеем дело — вопрос, требующий разбора.

Словообразовательная модель здесь двойная: сначала суффикс -енк-, который в восточнославянских фамилиях (особенно украинских и белорусских) указывал на потомка или малорослого человека: Моруженко — «сын или мальчик Моруга». Затем, при переходе фамилии в великорусскую среду, добавился типичный русский суффикс -ов, превративший Моруженко в Моруженкова. Такая «натурализация» украинских фамилий происходила массово в XVII–XIX веках, когда носители переселялись в центральные и южные губернии России.

Ключ к смыслу — в корне «Моруг-». Самое вероятное объяснение ведет к древнерусскому слову «моруг» — так в некоторых говорах называли человека смуглого, чернявого или просто неопрятного, грязного. В словаре Даля зафиксирован глагол «моружить» — пачкать, марать. Прозвище Моруг могли дать за внешность или за неряшливость. Менее распространенная, но возможная версия — связь с диалектным «моруха» (ненастье, мокрый снег) или с личным именем Мор, сокращенным от Мороз или Морислав, но эти гипотезы слабее: суффикс -уг- в прозвищах чаще указывал на признак, а не на имя.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским областям — Курской, Орловской, Воронежской губерниям, где пересекались украинское и русское население. Встречаются и однокоренные варианты: Моругов, Моругенко, Моружинский. Все они держатся на одном корне, но Моруженков выделяется своей «двухслойной» конструкцией, выдающей миграцию предков с Украины или юга России на север или восток. Сословно носители, скорее всего, были крестьянами или однодворцами — никаких данных о дворянских родах с такой фамилией не обнаруживается.