Фамилия Морженков образована по продуктивной модели с суффиксом -ов, который в русской ономастике указывает на принадлежность: «чей?» — Морженков, то есть сын или потомок Морженка. В центре фамилии стоит прозвище или некалендарное имя Моржонок (в диалектной форме Морженок). Основа здесь — «морж», и сразу возникает вопрос: кого на Руси называли моржом?

Версия, которая лежит на поверхности, — прозвище по внешности или поведению: крупный, неуклюжий человек, либо, наоборот, тот, кто не боится холода, купается в проруби. Но есть и менее очевидный, но более интересный вариант. В северных говорах, особенно в архангельских и поморских, «морж» — не только животное, но и опытный мореход, промышленник, добывавший моржа. Такое прозвище могли дать бывалому зверобою, кормщику или просто человеку, жившему у моря. Фамилия Морженков географически тяготеет именно к Русскому Северу, что подтверждается её концентрацией в Архангельской области, Карелии и Мурманской области.

Суффикс -енок (в диалектном произношении -онок) в основе Морженок характерен для севернорусской и сибирской традиции образования «детских» прозвищ: так называли младшего члена семьи или сына Моржа. Со временем прозвище превратилось в родовое имя, а суффикс -ов закрепил патронимическое значение. Фамилия редкая, не встречается в дворянских родословных книгах — её носителями, скорее всего, были государственные крестьяне, поморы или казаки. Встречается также вариант написания Марженков, но он вторичен и связан с аканьем — произносительным смешением «о» и «а» в безударной позиции.

Другие версии — связь с гидронимом Морж (река в Коми) или с диалектным «моржать» (мигать, щуриться) — выглядят натянутыми и не подкреплены ни географией фамилии, ни словообразовательной логикой. Основной корень здесь — именно морж, и предки Морженковых, вероятно, были людьми сурового северного промысла.