Фамилия Моруева — женская форма, а её мужской вариант — Моруев. Это русская фамилия, образованная по стандартной модели с суффиксом -ев. Суффикс указывает на принадлежность: Моруев — сын или потомок человека по прозвищу или имени Мор, Моруй.

Разбираем основу. Чаще всего фамилию связывают с прозвищем Мор. В древнерусском языке слово «мор» означало повальную болезнь, эпидемию, голод или смерть. Прозвище Мор могли дать человеку, пережившему тяжёлый мор, либо, по суеверной традиции, — чтобы «отвести» болезнь от ребёнка. Такие «охранительные» имена (Некрас, Нелюб, Мор) были распространены на Руси: считалось, что злые силы не позарятся на того, кого уже назвали плохим словом.

Вероятна и менее мрачная версия. В северных говорах, особенно в архангельских и вологодских, «моруй» — это разновидность рыбы, мелкая навага или корюшка. Прозвище Моруй могли дать рыбаку или человеку маленького роста, подвижному, «верткому», как рыбёшка. Фамилия Моруев тогда — «рыбацкая», указывающая на занятие предка.

Географически фамилия Моруев тяготеет к Русскому Северу. Встречается в Архангельской, Вологодской областях, в Карелии. Северное происхождение подтверждает и суффикс -ев, а не -ов: в северных говорах фамилии на -ев нередко образовывались от основ на мягкий согласный или й.

Таким образом, у фамилии Моруева два возможных корня: либо «защитное» прозвище от слова «мор», либо «рыбацкое» прозвище от «моруй». Оба варианта правдоподобны, но второй — с рыбой — встречается в ономастике реже, поэтому может быть более точным для конкретной семейной истории.