Фамилия Моругина хранит память о внешности или характере своего первого носителя. В её основе лежит прозвище Моруга, которое восходит к украинскому прилагательному «моругий», то есть «рыжий». Скорее всего, так называли человека с рыжими волосами: прозвище закреплялось за ним как самое употребительное именование, а уже потомки получили от него фамилию.

Впрочем, прозвище Моруга могло указывать и на особенности поведения. В народной традиции рыжий цвет нередко связывали с хитростью, бойкостью или вспыльчивостью, поэтому нельзя исключать, что прозвище отражало не столько внешность, сколько нрав предка. Обе версии правдоподобны, но первая — с указанием на цвет волос — выглядит более прямой и естественной для бытового именования.

Суффикс -ин в фамилии Моругина указывает на принадлежность: Моругина — это «дочь или жена Моруги», а мужская форма Моругин — «сын Моруги». Такая модель образования типична для русских фамилий, но основа здесь нечастая: слово «моругий» в письменных источниках встречается редко и живёт в основном в южнорусских и украинских говорах. Это делает фамилию заметной на фоне более распространённых «цветовых» фамилий вроде Рыжова или Чернова.

Род Моругиных, таким образом, ведёт начало от человека с яркой внешностью или характером. Прозвище, данное ему в быту, со временем вытеснило другие именования и закрепилось за потомками, превратившись в фамилию. Сегодня она продолжает нести память о том, каким увидели предка окружающие — и что именно в нём запомнилось сильнее всего.