Фамилия Мошкова чаще всего звучит как женская форма, но в её основе лежит мужское имя или прозвище Мошко. Это просторечная, обиходная форма, которая восходит к целому ряду церковных имён, и здесь исследователи не дают однозначного ответа. Самая распространённая версия связывает Мошко с именем Мирон (в переводе с греческого — «благоухающий»). Вторая, не менее правдоподобная гипотеза, возводит его к имени Парамон (греч. «надёжный», «верный»). Наконец, в некоторых говорах так могли называть человека, носящего библейское имя Моисей — вождя и законодателя, которому приписывают авторство Пятикнижия.

Почему возникла такая путаница? В народной среде имена сокращали и перекраивали на свой лад, подгоняя под привычное звучание. Форма Мошко легко получалась из любого из этих имён: от Мирона через промежуточное Мишко, от Парамона — через Памошко, а от Моисея — напрямую. Поэтому, определяя происхождение фамилии, мы говорим не об одном конкретном предке, а о целой группе возможных тёзок, чьи имена в быту свелись к единому звучанию.

Сама фамилия образована по стандартной для русских фамилий модели: к основе Мошко добавили притяжательный суффикс -ов, а затем и окончание женского рода -а. Изначально форма Мошкова отвечала на вопрос «чья?» и означала «дочь или жена Мошко». Потомок человека, обладающего именем Мошко, со временем получал фамилию Мошков, а его супруга или дочь записывались как Мошковы.

Интересно, что однокоренные фамилии — Мошков, Мошкин, Мошкович — встречаются по всей России, но особенно часто в северных и центральных регионах, где была сильна традиция мирских имён. Впрочем, точную географию проследить сложно: фамилия нередко встречается и в старинных боярских списках, и в крестьянских переписях, что говорит о её широкой распространённости среди разных сословий.