Фамилия Мошкин образована от имени Мошка — так в старину в просторечии называли человека, носившего одно из церковных имён. Чаще всего это была форма имени Мирон (в переводе с греческого — «благоухающий»), но также могли звать Парамона («твердый», «надёжный», «верный») или Моисея (предположительно от египетского «извлеченный из воды»). То есть за фамилией стоит не прозвище, а сокращённое домашнее имя, которое использовали в повседневной жизни наряду с крестильным.

Интересно, что эта фамилия — яркий пример того, как народная традиция перекраивала звучание имён до неузнаваемости. От одного корня образовались и другие фамилии: Мошков, Мошковцев, а также Мошаров. Все они указывают на одного и того же предка — человека по имени Мошка. Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: Мошкин буквально значит «сын Мошки», «ребёнок Мошки».

Слово «мошка» в значении насекомого к фамилии отношения не имеет, хотя такое совпадение и создаёт ложное впечатление. В русской ономастике подобные случаи не редкость: звучание основы совпадает с бытовым словом, но происхождение у неё совсем иное. Если опираться на словарь Б. Унбегауна и работы В. Никонова, модель, при которой краткая форма имени даёт фамилию через суффикс -ин, одна из самых распространённых в северных и центральных русских говорах.

Встречается Мошкин по всей России, но особенно часто — в Поволжье и на Русском Севере, где такие «домашние» формы имён приживались охотнее. Среди носителей фамилии были и крестьяне, и мещане, и священники — сословной привязки у неё нет, потому что имя Мошка давали в самых разных слоях общества. Отдельной дворянской ветви с такой фамилией не зафиксировано, что лишний раз подтверждает её народное, «низовое» происхождение.

Если ваш предок носил фамилию Мошкин, скорее всего, его родословная уходит в среду простых людей, где имя Мирон или Моисей в быту сокращали до ласкового Мошка. Со временем это сокращение закрепилось за семьёй и передалось потомкам уже как фамилия.