Фамилия Моташенко — яркий пример украинской модели фамилий на -енко, которая в XVII–XVIII веках стала главным маркером «сыновства» в казацкой среде. Суффикс -енко буквально означал «маленький» или «сын такого-то», и в итоге из прозвища отца закрепился за целым родом. Основа здесь — Моташ, а это, скорее всего, сокращённая форма от крестильного имени Тимофей (в народном произношении — Тимоха, Мотоха, Моташ). Украинские фамилии нередко «съедали» начало имени: так Тимофей превращался в Моташенко, а Емельян — в Моташенко (от Мотя, уменьшительного от Емельян). Вторая версия, менее распространённая, связывает Моташа с прозвищем от глагола «мотать» — так могли назвать непоседливого человека или того, кто мотал нитки, занимался прядением. Но для фамилий на -енко типичнее именно имя-основа.

Географически фамилия плотно привязана к левобережной Украине — Полтавщине, Черниговщине, Сумщине. В реестрах Запорожского войска и метрических книгах XVIII века встречаются однофамильцы с теми же корнями, что подтверждает казацкое происхождение многих родов. В России фамилия редкая, чаще встречается в южных областях, куда переселялись украинские крестьяне и казаки.

Интересная деталь: написание через «а» (Моташенко) — нормативное украинское, а в русских документах XIX века можно встретить вариант «Моташенко» с ударением на второй слог, что отражает местный говор. Сословно предки Моташенко — в основном казаки или крестьяне, дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. Фамилия не потеряла прозрачности: любой украинец сразу поймёт, что перед ним «сын Моташа», то есть потомок человека, которого в быту звали уменьшительно от Тимофея.