Фамилия Мудунов — редкий пример, где географический ключ даёт больше, чем морфологический разбор. Суффикс -ов прямо указывает на русскую модель образования: так в XIX веке оформляли фамилии крестьянам и мещанам, отсекая конечный гласный основы. Но вот сама основа — Мудун — в русском языке не встречается ни как нарицательное слово, ни как крестильное имя.

Здесь и начинается главное. Фамилия Мудунов почти наверняка имеет тюркские или кавказские корни, причём не единый источник, а целое гнездо возможных значений. Самая прямая версия — от тюркского слова «мудун» или «будун», которое в некоторых диалектах означает «глупый», «дурак». Прозвище, данное в насмешку или для оберега (чтобы злые духи не позарились на умного ребёнка), со временем закрепилось как фамилия. Такая практика широко известна в ономастике: тюркские фамилии нередко восходят к бытовым характеристикам.

Вторая версия — топонимическая. В Дагестане, особенно в Кулинском и Лакском районах, встречается селение Мудун. Житель такого аула получал прозвище Мудун, а его потомки — фамилию Мудуновы. Это типичная модель для горских народов Кавказа, где фамилия часто привязана к месту происхождения, а не к личному имени.

Третья, менее вероятная, но возможная гипотеза — связь с арабским именем Мадун или Мадан (от «мадаин» — города, поселения). В этом случае фамилия прошла через тюркскую или кавказскую языковую среду, где звук «а» мог перейти в «у», а суффикс -ов добавился при русификации.

Сословная принадлежность Мудуновых не определена: фамилия не встречается в дворянских родословных книгах, а значит, предки были скорее всего крестьянами, ремесленниками или казаками. В современных телефонных справочниках и базах данных Мудуновы чаще всего фиксируются в Дагестане, Ставропольском крае и Ростовской области — что подтверждает северокавказскую привязку.

Редкий суффикс -ов при тюркской основе сам по себе — маркер поздней русификации. Если бы фамилия осталась в исконной форме, она звучала бы как Мудун или Мудунов (без суффикса), но в русском паспортном учёте XIX века её «подогнали» под стандарт. Поэтому Мудунов — не столько «сын Мудуна», сколько «записанный из Мудуна» или «прозванный Мудуном».