Фамилия Мухуддинов имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркских носителей, а именно выходцев из Золотой Орды: или от печенегов, или от половцев. Соответственно, своими корнями фамилия Мухуддинов уходит в XV-XVII вв. Сведения в родословной о восточном происхождении фамилии Мухуддинов являются более или менее точными и подтверждаются соответствующими восточным именем ее родоначальника. Фамилия Мухуддинов образована от восточного имени Мухутдин, которое в переводе с арабского означает «возрождающий, укрепляющий, защищающий религию». Менее вероятно, что это имя происходит от двух основ: тюркской «мухут» - «океан» и арабской «дин» - «вера, религия». Таким образом, имя Мухутдин может означать «вера, великая, как океан». Проникновению инонациональных основ в состав русских фамилий, и в частности в состав фамилии Мухуддинов способствовал тот исторический факт, что многие дворяне в России были по своему происхождению нерусскими. Тем не менее, фамилия Мухуддинов представляет собой замечательный памятник восточной письменности и культуры.