Фамилия Мухудинов образована от восточного имени Мухудин (Мухутдин), которое в переводе с арабского означает «возрождающий, укрепляющий, защищающий религию». Менее вероятно, что это имя происходит от двух основ: тюркской «мухут» - «океан» и арабской «дин» - «вера, религия». Таким образом, имя Мухудин может означать «вера, великая, как океан». Также не исключено, что Мухут — это производная форма арабского имени Мухаммед, которое переводится с арабского как «восхваляемый, прославляемый». Мухаммедом звали наиболее почитаемого мусульманами пророка - основателя исламской религии. Следовательно, имя Мухудин может означать «вера Мухаммеда».