Фамилия Муковина — одна из тех, что образована напрямую от названия ремесла или продукта. Основа здесь очевидна: «мука». Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: чей? — Муковин, то есть сын или работник человека, связанного с мукой. В женском роде фамилия закрепилась как Муковина. Но если присмотреться, в этой фамилии спрятана нестандартная словообразовательная деталь.

Обычно фамилии от названий продуктов образуются через суффикс «-ник» (Мельник, Крупеник) или через «-ев» (Мукаев, Муков). Здесь же мы видим редкую модель: прямое присоединение «-ин» к основе «муков-». Это говорит о том, что прозвище «Мукова» или «Муковин» могло быть не просто профессиональным, а ироничным или бытовым. Например, «мукова» — так в некоторых говорах называли человека, который вечно весь в муке, бледного или чрезмерно прилежного в помоле.

Географически фамилия редкая. Встречается в основном на юге России и в Поволжье — зонах активного земледелия и переработки зерна. Там, где работали ветряные или водяные мельницы, прозвище могло закрепиться за мельником, его помощником или даже за торговцем мукой. Вторая, менее очевидная версия: в некоторых диалектах «муковина» — это не мука, а мучнистое вещество, плесень или осадок. Тогда прозвище давали человеку с неопрятной внешностью или болезненным цветом лица.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Муков, Мукин, Муковнин — показывает, что именно форма Муковина стоит особняком. Она не получила широкого распространения, не стала дворянской или купеческой, что намекает на крестьянское или посадское происхождение. В дореволюционных переписях носители этой фамилии чаще всего числились государственными крестьянами или мещанами, то есть свободными, но небогатыми людьми.

Споров вокруг этимологии почти нет: корень ясен, суффикс стандартный. Если и есть сомнения, то лишь в том, было ли исходное слово «муковина» самостоятельным именем нарицательным или же это отчество от прозвища «Мукова». Первая версия правдоподобнее, так как в русских говорах слово «муковина» фиксируется в значении «мучная пыль» или «мучной мешок», что легко становилось бытовым прозвищем.