Фамилия Муковин — одна из тех, что образована не напрямую от названия профессии, а от прозвища, которое профессию обозначало. В её основе лежит слово «мука́» — продукт помола зерна. Но не спешите записывать предка-носителя этой фамилии в мельники или торговцы мукой. Прямое указание на ремесло дали бы фамилии Мельников, Мукосей или Муковоз. Муковин — другое дело.

Скорее всего, прозвище Мукова получил человек, имевший к муке косвенное отношение: возможно, он был белым, бледным, «мучнистым» лицом, либо отличался мягким, податливым характером — рассыпчатым, как мука. В русских говорах «муковный» означало и «обильный мукой», и «сделанный из муки», но в прозвище чаще вкладывали переносный смысл. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Муковин, то есть сын или потомок Муковы.

Есть и менее очевидная версия. В некоторых диалектах «мукова» могли называть человека, который постоянно возится с тестом, печёт хлеб, но не был профессиональным пекарем (отсюда и не Пекарев). Это прозвище могли дать домовитому, хозяйственному крестьянину, который славился своим хлебом. Интересно, что фамилия Муковин встречается преимущественно в центральных и южнорусских областях — там, где было развито земледелие и переработка зерна, а не на севере, где мука была привозным товаром.

Обратите внимание на редкость этой фамилии. Она не вошла в массовые списки дворянских или купеческих родов, не попала в число распространённых крестьянских фамилий. Это говорит о том, что прозвище Мукова было локальным, возможно, существовало в одной-двух деревнях. В отличие от многочисленных Мукосеев или Муковозов, Муковины — штучный случай, и их родословная, скорее всего, ведётся от одного реального человека по прозвищу Мукова, жившего в XVII–XVIII веках.