Она ведет свое начало от двух имен: Мулла и Гаян. Первое из них ведет свое начало от арабского слова mella, т.е. Второе имя — Гаян — также имеет арабское происхождение и переводится как «знатный». Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Мулла-Гаяновых можно лишь на основании генеалогических исследований.