Фамилия Мунина — это типичная русская «семейная» фамилия, которая говорит о том, что её основательницу или основателя в округе знали под прозвищем Муня. Сама по себе форма на -ин указывает на принадлежность: Мунина буквально значит «дочь (или жена) Муни». Но вот откуда взялось само прозвище — вопрос, на который у ономастов нет однозначного ответа, и здесь открывается простор для версий.

Самая распространённая версия связывает прозвище Муня с диалектным глаголом «мунить». В разных говорах это слово означало «мешкать», «тянуть», «делать что-то вяло». Соответственно, Мунёй в народе могли прозвать сонного, медлительного или ленивого человека. Это прямое указание на характер: предок, получивший такое прозвище, вероятно, не отличался бойкостью и расторопностью. Впрочем, у этого же корня есть и другое, неожиданное значение — «рыба-вьюн». Если придерживаться этой трактовки, то прозвище могло закрепиться за рыбаком, который ловил или продавал вьюнов, либо за человеком, который вёл себя юрко и ускользающе, как эта рыба.

Вторая гипотеза уводит нас далеко на северо-восток России. Муна — это река в Якутии, левый приток Лены. Если следовать этой версии, то Мунёй могли называть человека, который родился на берегах этой реки или долго там жил. Такая практика — давать прозвища по месту жительства или происхождения — была очень распространена на Руси. Однако эта версия кажется менее вероятной для большинства носителей фамилии: гидроним Муна, хоть и значимый для Якутии, вряд ли был известен в центральных регионах России, где фамилия, скорее всего, и сформировалась.

Интересно, что фамилия Мунина стоит в одном ряду с такими «короткими» фамилиями, как Мунин, Мунихин, Муняев. Все они образованы от одной и той же основы — Муня, которая в старину могла быть не только прозвищем, но и уменьшительной формой редких крестильных имён. Например, в некоторых областях так могли сокращать имя Мунет или даже Еремей. Это добавляет ещё один штрих к картине: прозвище могло возникнуть в семейном кругу и лишь потом закрепиться за родом.

Что касается окончания, то фамилия Мунина — это женская форма. Мужской вариант — Мунин. Такая пара характерна для центральной России, где притяжательные прилагательные с суффиксом -ин легко превращались в фамилии. Со временем, когда прозвище Муня перестало употребляться в быту, оно сохранилось именно в фамилии, закрепив за потомками память о предке — то ли неторопливом человеке, то ли ловком рыбаке, то ли выходце с далёкой северной реки.