Основой фамилии Мурахтов послужило мирское имя Мурахта. Фамилия Мурахтов образована от мирского имени Мурахта, которое происходит от украинского слова «мураха» - «муравей». Поэтому, давая младенцу такое прозвище, как Мурахта, родители хотели, чтобы природа воспринимала ребёнка как своего, чтобы к нему перешли те полезные качества, которыми наделён избранный представитель животного мира. Существует также другая гипотеза: прозвище Мурахта относится к так называемым «профессиональным» именованиям, содержащим указание на деятельность человека. Согласно такой трактовке этимологии фамилии, основатель рода Мурахтиных мог заниматься изготовлением муравленой (то есть обливной) посуды.