Фамилия Мурахтов напрямую связана с миром природы, а точнее — с муравьём. В её основе лежит мирское имя или прозвище Мурахта, которое восходит к украинскому слову «мураха», то есть «муравей». Называя ребёнка Мурахтой, родители следовали древней традиции: они словно «представляли» младенца природе, чтобы та приняла его за своего. Считалось, что вместе с именем к человеку переходят и качества тотемного животного — в данном случае трудолюбие, запасливость и умение сообща строить свой дом.

Впрочем, у этой фамилии есть и вторая, менее поэтичная, но вполне реальная версия происхождения. Прозвище Мурахта могло быть профессиональным именованием. В этом случае основатель рода занимался изготовлением муравленой посуды. Муравлёной, или обливной, называли керамику, покрытую глазурью — обычно зелёного цвета. Этот промысел был широко распространён в украинских и южнорусских землях, поэтому обе трактовки имеют под собой почву.

Если придерживаться первой версии, то фамилия Мурахтов входит в обширный пласт «животных» фамилий, где рядом стоят Соколовы, Волковы, Бобровы. Но украинский корень выделяет её на общем фоне: она указывает не столько на характер человека, сколько на культурные и языковые корни рода. Суффикс -ов в данном случае — стандартный русский патронимический формант, отвечающий на вопрос «чей?», то есть «сын Мурахты».

Вторая версия роднит Мурахтовых с фамилиями Гончаров, Кузнецов или Горшечников. Различие между гипотезами существенное: в одном случае предок носил ласковое прозвище по насекомому, в другом — был ремесленником, чьё дело знали в округе. Однозначно ответить, какая из них верна для конкретной семьи, невозможно — это определяется только по глубоким архивным изысканиям. Но для носителя фамилии обе версии дают повод гордиться: либо предки были людьми наблюдательными и поэтичными, либо умелыми мастерами, чьи изделия украшали столы и дома.

Сама фамилия звучит довольно редко и сохраняет яркий национальный колорит, что делает её легко узнаваемой. Встречается она преимущественно в тех регионах, где исторически пересекались русское и украинское население, — на юге России, в Поволжье и в областях, граничащих с Украиной.