Основой фамилии Мурахтин послужило мирское имя Мурахта. Фамилия Мурахтин образована от мирского имени Мурахта, которое происходит от украинского слова «мураха» - «муравей». Поэтому, давая младенцу такое прозвище, как Мурахта, родители хотели, чтобы природа воспринимала ребёнка как своего, чтобы к нему перешли те полезные качества, которыми наделён избранный представитель животного мира. Существует также другая гипотеза: прозвище Мурахта относится к так называемым «профессиональным» именованиям, содержащим указание на деятельность человека. Согласно такой трактовке этимологии фамилии, основатель рода Мурахтиных мог заниматься изготовлением муравленой (то есть обливной) посуды. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Мурахта, со временем получил фамилию Мурахтин.