Фамилия Мураткова — женская форма фамилии Муратков. В основе лежит имя Мурат, которое в русской среде чаще всего воспринимается как вариант крестильного имени Никита (от греческого «победитель»), хотя по происхождению это отдельное арабское имя Мурад (مراد) — «желанный», «цель». В тюркских языках, особенно у татар и башкир, имя Мурат (Мурад) было очень распространено, и именно из этой среды фамилия, скорее всего, пришла в русский ономастикон.

Модель образования простая: к основе Мурат добавили патронимический суффикс -к- (уменьшительный или указывающий на принадлежность к роду), а затем типичный русский суффикс -ов. Получается: «сын (или потомок) маленького Мурата» или «из рода Мурата». Суффикс -к- в русских фамилиях встречается реже, чем -ов/-ев, и часто указывает на западнорусское (белорусское, украинское) влияние или на прозвищное происхождение. В случае с Муратковым этот суффикс мог закрепиться в устной речи, а потом уже оформиться в полную фамилию.

Географически фамилия Муратов (и её производные Мураткова, Муратко) чаще всего встречается в Поволжье — в Татарстане, Башкортостане, а также в Оренбургской и Самарской областях. Это объясняется исторически: татары и башкиры, принимая православие, часто сохраняли родовые имена, которые затем русифицировались через стандартные фамильные суффиксы. Носительница фамилии Мураткова с высокой вероятностью имеет предков из числа крещёных татар (кряшенов) или из русских семей, живших в тесном соседстве с тюркским населением.

В отличие от фамилии Муратов (самой частой в этом ряду), Мураткова — более редкая. Форма с -к- могла возникнуть в конкретной местности как фамилия одного рода, а не как массовое образование. Если ваш предок был Муратко, то фамилия могла закрепиться именно как отчество от этого прозвища, а не от полного имени. В любом случае, корень один — арабское имя со значением «желанный», что делает фамилию не просто указанием на родство, а своего рода пожеланием или характеристикой далёкого предка.