Фамилия Мурысин образована от прозвища или нецерковного имени Мурыса. Основа здесь — глагол «мурысить» или «мурызгать», который в русских говорах означал «тереть», «мять», «чесать» или «делать что-то медленно, возиться». Человек, которого прозвали Мурысой, мог быть либо тем, кто постоянно что-то трёт или мнёт (например, в кожевенном или сапожном деле), либо кропотливым, медлительным работником. Вторая версия отсылает к диалектному «мурыга» — так в некоторых областях называли бродягу или неряху, но это значение менее распространено.

Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: Мурысин — «сын Мурысы» или «из семьи Мурысы». Модель типична для русских фамилий, образованных от основ на -а/-я (ср. Галкин, Птицын). Если бы основа заканчивалась на согласный, появился бы суффикс -ов: Мурысов, но в данном случае форма Мурысин устоялась именно в северных и центральных областях России, где -ин встречается чаще.

Географически фамилия редкая. Основные очаги — Тамбовская, Рязанская и Нижегородская области. Встречается также в Поволжье, что может говорить о переселении крестьян в XIX веке. В документах XVII–XVIII веков фамилия не фиксируется, что типично для прозвищных фамилий, закрепившихся в крестьянской среде после отмены крепостного права.

Среди однокоренных фамилий — Мурыгин, Мурылев, Мурышев. Они образованы от тех же корней, но с разными суффиксами. Мурысин стоит особняком: суффикс -ин при основе на -а делает её более «древней» по модели, хотя сама фамилия моложе многих дворянских. Дворянских родов с такой фамилией нет — это стопроцентно крестьянская или мещанская фамилия, без гербов и столбовых записей.