Фамилия Мурзафазылова — яркий пример тюркско-персидского именослова, закрепившегося в русской фамильной системе. Она образована от мужского имени Мурзафазыл, которое состоит из двух частей. Первая, «мурза» (от персидского «мирза» — «княжич», «господин» или «писарь»), в тюркской среде означала знатного человека, иногда — грамотного чиновника. Вторая, «фазыл» (арабское «фадиль» — «достойный», «добродетельный»), придаёт имени значение «благородный господин» или «достойный князь». Суффикс «-ова» указывает на принадлежность: Мурзафазылова — «дочь (или жена) Мурзафазыла».

Слово «мурза» в русских документах XV–XVII веков часто встречалось как титул татарской знати. Поэтому носитель фамилии, скорее всего, происходил из служилых татар или башкир, которые после присоединения Поволжья и Приуралья к Московскому государству переходили на русскую службу. Фамилия могла закрепиться в среде мишарей или казанских татар, где составные имена с «мурза» были распространены.

Географически фамилия тяготеет к регионам компактного проживания татар и башкир: Татарстан, Башкортостан, Оренбургская и Челябинская области. Встречается она редко, что говорит о её локальном бытовании — возможно, родоначальник был заметной фигурой в одном конкретном селе или волости. В отличие от фамилий на «-ов» от простых имён (Иванов, Петров), эта сохраняет двойную семантическую нагрузку: и социальный статус, и личное качество. Правописание с «з» вместо «с» (Мурзафазылов, а не Мурзафасылов) указывает на арабский источник второй части имени, где буква «дад» передаёт звук, близкий к «з».