Фамилия Мусалина — женская форма, образованная от мужской фамилии Мусалин. Её основа, судя по всему, восходит к имени или прозвищу Мусал. В русской ономастике слово «мусал» имеет два основных значения. Первое — это диалектное название большого молота, кувалды, которой пользовались кузнецы или камнетёсы. Второе — тюркское имя Муса, арабского происхождения (библейский Моисей), которое в просторечии могло получить уменьшительно-ласкательную форму Мусал.

Модель образования типична для русских фамилий: суффикс -ин (-ын) указывает на принадлежность: «чей?» — сын или потомок Мусала. То есть первый носитель фамилии был либо сыном человека по имени Мусал, либо, что вероятнее, сам получил прозвище за профессию — кузнеца или молотобойца. В пользу прозвищного происхождения говорит то, что фамилии от названий инструментов встречаются в русской среде нередко (Молотов, Топоров, Ножов).

Географически фамилия Мусалин (и Мусалина) встречается в Поволжье и на Урале, в зоне активных русско-татарских контактов. Это неудивительно: тюркское имя Мусал легко вписалось в русскую фамильную модель. Встречается она и у крещёных татар, и у русских, чьи предки могли перенять прозвище у соседей-инородцев.

Интересная деталь: в некоторых говорах слово «мусал» означало не только молот, но и «болван», «неповоротливый человек». Если фамилия пошла от такого значения, то предок мог получить её не за ремесло, а за характер. Однако прозвища такого рода редко закреплялись в качестве фамилий без дополнительной профессиональной привязки. Поэтому версия с кузнечным молотом выглядит правдоподобнее.