Фамилия Мусёна — редкая, с нетипичным для русской ономастики окончанием -ёна. Такое завершение почти не встречается в стандартных фамилиях на -ов, -ин или -ский. Скорее всего, перед нами белорусская или украинская фамилия, где -ёна — это русифицированная форма суффикса -еня (например, Макареня, Коваленя), который образует отчества или прозвища. В этом случае основа Мус- может восходить к личному имени или прозвищу.

Корень Мус- вероятнее всего связан с именем Мусий — народной формой канонического имени Моисей. В украинском и белорусском говорах Моисей превращался в Мусий, отсюда же фамилии Мусиенко, Мусевич, Мусенко. Мусёна тогда может быть производным от «Муся» (сын или потомок Мусия) с характерным западнорусским суффиксальным оформлением.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным словом «муса» (путаница, неразбериха) или с тюркскими заимствованиями, где «муса» означает «кошка» или «точильный камень». Но вторая гипотеза слабая: носители такой фамилии не фиксируются в регионах с сильным тюркским влиянием, а в белорусских и украинских метриках XIX века встречаются крестьяне и мещане с фамилией Мусёна и её вариантами.

Географически фамилия привязана к западным губерниям Российской империи — Могилёвской, Витебской, Киевской. В переписях начала XX века Мусёна упоминается среди жителей Черниговщины, что подтверждает её украинско-белорусское происхождение. Социальный контекст: носители фамилии — в основном крестьяне, реже — духовенство (униатские священники могли носить такие окончания).

Таким образом, Мусёна — это не случайное искажение, а закономерная фамилия, образованная от имени Мусий с помощью уменьшительно-патронимического суффикса. Её редкость объясняется узкорегиональным бытованием и тем, что в советское время многие носители русифицировали окончание на -ов, превратившись в Мусеновых.