Фамилия Мушаева происходит от древнего калмыцкого имени Муша, и это сразу многое говорит о её происхождении. В основе имени лежит калмыцкая основа «му» со значением «плохой», а компонент «-ша» — это суффикс, который в калмыцкой традиции активно использовался для образования личных имён.

Скорее всего, имя Муша относится к так называемым охранительным именованиям. Смысл этого обычая прост: нарекая младенца именем с негативным значением, родные стремились обмануть злых духов, показав им, что ребёнок не представляет ценности. Считалось, что таким образом все беды и болезни обойдут его стороной, а сама «плохая» часть имени станет своеобразным оберегом. Поэтому человек, предка которого звали Муша, со временем и получил фамилию Мушаев — по обычной модели, когда имя отца превращалось в фамилию сына.

Здесь стоит подчеркнуть, что эта фамилия — женская форма, а мужская, Мушаев, образована с помощью патронимического суффикса «-ев», который присоединяется к основам на мягкий согласный или «ш». Сама фамилия — яркий пример того, как калмыцкая антропонимия встроилась в общероссийскую модель образования фамилий, сохранив при этом свою этническую уникальность.

Представители фамилии Мушаевых внесены в некоторые исторические источники, что позволяет прикоснуться к их реальным судьбам. Так, в Книге памяти ссылки калмыцкого народа упоминаются Андрей Берикович Мушаев, родившийся в 1941 году в поселке Адык Черноземельского улуса Калмыкии, и Бадм Башангиевич Мушаев, родившийся в 1915 году в хуторе Хучн Багацохуровского улуса Калмыцкой степи Астраханской губернии. Эти записи — не просто сухие строки, а свидетельства трагической истории депортации калмыцкого народа, через которую прошли многие носители этой фамилии. География этих записей — Черноземельский и Багацохуровский улусы — подтверждает, что фамилия была распространена в степных районах Калмыкии и Нижнего Поволжья.