Фамилия Мущинина — это женская форма, а её основа — мужская фамилия Мущинин. Эта фамилия относится к «патронимическому» типу и образована с помощью суффикса -ин, который в русском языке указывает на принадлежность: «чей?» — Мущинин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Мущина.

Само прозвище Мущина — редкое и неочевидное. Первое, что приходит на ум, — связь со словом «мужчина». Однако в древнерусском языке слово «мущина» (или «мужчина») имело значение не просто «лицо мужского пола», а «муж, супруг» или «взрослый мужчина, воин». Прозвище могли дать крепкому, сильному человеку, главе семьи, либо, наоборот, в ироничном ключе — тому, кто вёл себя слишком мужественно для своего возраста или положения.

Есть и другая, менее очевидная версия. В некоторых говорах «мущина» — это не человек, а предмет: так могли называть мешок, котомку или узел с поклажей. В этом случае прозвище Мущина мог получить торговец, странник или просто неряшливый человек, который таскал за собой много вещей. Эта версия, хоть и не основная, вполне правдоподобна, поскольку прозвища от названий предметов быта — обычное дело.

Фамилия Мущинин встречается нечасто. Она характерна для северных и центральных областей России, где хорошо сохранились архаичные прозвищные формы. Судя по историческим записям, в XVI–XVII веках в вятских и пермских землях фиксировались крестьяне с похожими прозвищами, что подтверждает народное, а не книжное происхождение фамилии.

Словообразовательная модель проста: основа «Мущин-» плюс суффикс -ин. Ударение в фамилии обычно падает на второй слог: Мущи́нин. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые образуются от названий профессий или животных, -ин чаще прикрепляется к личным именам и прозвищам, оканчивающимся на -а/-я. Так что Мущинин — это именно «сын Мущины», что делает её типичной для русского Севера и Поволжья.