Фамилия Мусифуллина — женская форма от Мусифуллин, и её разумнее всего разбирать в мужском варианте. Это фамилия тюркского происхождения, характерная для татарской, башкирской и других тюркоязычных сред. В основе лежит арабское имя или прозвище, адаптированное через тюркское произношение.

Корень — «Мусифулла» или «Мусифуллах», что восходит к арабскому «мусиф» (справедливый, правосудный) в сочетании с «Аллах». Таким образом, имя-основа означает «справедливый раб Аллаха» или «тот, кто вершит правосудие по воле Бога». Это типичная для исламского ономастикона конструкция, где личное качество соединяется с именем Всевышнего. Формант «-улла(х)» широко распространён в мусульманских именах (например, Абдулла, Фазулла).

Суффикс «-ин» указывает на принадлежность к роду: Мусифуллин — буквально «сын Мусифуллы», «из рода Мусифуллы». В русской паспортной традиции такие фамилии получили окончание «-ин» по аналогии с русскими фамилиями на «-ин», хотя в тюркских языках притяжательность могла выражаться иначе. Написание с двойным «л» — «Мусифуллина» — закрепилось в документах, но в устной речи часто редуцируется до одинарного.

Географически фамилия встречается в Татарстане, Башкортостане, а также в регионах Поволжья и Урала, куда переселялись татары. Редкость фамилии делает её хорошим маркером локальной ветви: скорее всего, предки носителя были связаны с конкретным селом или родом, а не с широко распространённой династией. Сословно носители могли быть как крестьянами, так и муллами или торговцами — имя с религиозным оттенком нередко давали в семьях, где ценили грамотность и знание ислама.

Однокоренных фамилий в русском контексте практически нет, что подчёркивает уникальность основы. Если встретите вариант «Мусифулов» — это более редкая русификация с другим суффиксом, но корень тот же.