Фамилия Мусоева — женская форма фамилии Мусоев. Её основа восходит к личному имени Муса — арабскому варианту библейского Моисей (Моше). В исламской традиции пророк Муса — один из самых почитаемых персонажей, поэтому имя широко распространено у народов, исповедующих ислам: татар, башкир, чеченцев, ингушей, народов Дагестана, а также у таджиков и узбеков.

Фамилия образована по тюркской модели с суффиксом -ев, который в русской среде закрепился как патронимический. В данном случае суффикс указывает на принадлежность к роду человека по имени Муса. То есть Мусоев — буквально «сын Мусы», «потомок Мусы». Ударение в фамилии обычно падает на второй слог: Мусо́ева.

Стоит обратить внимание на написание: в русском языке часто встречается вариант «Мусаев» — через «а» во втором слоге. Форма «Мусоев» с буквой «о» характерна для осетинского языка и некоторых диалектов тюркских языков, где гласный звук в имени Муса произносится ближе к «о». Таким образом, Мусоева — это не ошибка, а региональный или языковой вариант, закрепившийся в документах. В Осетии, например, фамилии Мусоевы встречаются довольно часто, особенно среди дигорцев.

В дореволюционной России фамилия не была дворянской и не давала привилегий. Носители — в основном крестьяне, ремесленники и казаки, переселявшиеся в регионы Северного Кавказа и Поволжья. Сегодня Мусоевых можно встретить по всей России, но наибольшая концентрация сохраняется на Северном Кавказе и в среде осетинской диаспоры.