Фамилия Муссарыгина — женская форма мужской фамилии Муссарыгин. Её основа, скорее всего, связана с тюркскими корнями, что типично для фамилий, возникших на юге России или в Поволжье. Разберём словообразовательную модель: суффикс -ин (в мужском варианте -ин) указывает на принадлежность: «чей?» — «сын Муссарыги». Сама же основа «Муссарыг» или «Муссарык» — это, по всей видимости, прозвище или имя, образованное от тюркского «муса» (Моисей в арабо-мусульманской традиции, пророк Муса) и «рыг/рык» — возможно, искажённое «арык» (арык, канал) или «арыг» (чистый, святой). В таком случае прозвище могло означать «чистый Муса» или «Муса-арык», то есть человек, живший у канала, названного в честь Мусы.

Другая, менее правдоподобная версия выводит фамилию из иранских языков, где «муссарыг» могло быть названием ремесленника, работавшего с медью или серебром (от «мис» — медь). Но эта гипотеза слабая: в иранских языках нет устойчивого термина с таким звучанием.

Фамилия редкая, её географическое бытование сегодня — преимущественно Западная Сибирь и Урал, куда в XIX–XX веках переселялись крестьяне из южных губерний. В дореволюционных метрических книгах Оренбургской и Уфимской губерний встречаются записи о Муссарыгиных — крестьянах-старообрядцах или государственных крестьянах. Сословно это, скорее всего, недворянская фамилия: суффикс -ин типичен для крестьянских и мещанских родов, образованных от прозвищ или имён, а не от географических названий.

Обратите внимание на написание: двойная «с» и буква «ы» в корне — признак тюркского происхождения. В русских фамилиях такой корень могли записать и как «Мусарыгин», но вариант с двумя «с» встречается чаще, что указывает на фиксацию произношения с долгим согласным, характерным для татарского или башкирского языков.