Фамилия Мустафина — женская форма фамилии Мустафин, и разговор о ней стоит начать с мужского варианта, поскольку именно он хранит ключ к происхождению. В основе фамилии лежит арабское имя Мустафа, которое переводят как «избранный», «единственный». Это один из эпитетов пророка Мухаммада, поэтому имя издревле пользовалось особым почетом у мусульманских народов, и называть так сына считалось благим пожеланием.

Фамилию образовали по классической русской модели: к восточному имени добавили притяжательный суффикс -ин, который отвечает на вопрос «чей?». Так, Мустафин буквально означает «сын Мустафы», «принадлежащий Мустафе». Подобная схема адаптации тюркских и арабских имен встречается у многих народов Поволжья и Урала, где русский язык веками соседствовал с татарским и башкирским.

Процесс формирования фамилий у татар, башкир и других народов региона был длительным. Массово они закреплялись в XIX веке, когда после реформ начался учет населения и возникла необходимость в наследственных семейных именованиях. Однако отдельные роды могли получить фамилию и раньше, особенно если их предки служили в русской администрации или имели дело с документами. Поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения конкретного рода Мустафиных можно только на основе генеалогических исследований — записей в метрических книгах, ревизских сказках или переписях.

Интересно, что имя Мустафа в разных диалектах и языках могло звучать по-разному: у казахов и узбеков встречается форма Мустапа, у некоторых тюркских народов — Мустафай. Это породило целое гнездо родственных фамилий: Мустафин, Мустафиев, Мустафуллин (с арабским компонентом «улла» — «Божий»). Все они восходят к одному корню, но каждая закрепилась в своей этнической среде.

Сегодня фамилия Мустафина широко распространена в Татарстане, Башкортостане, в Оренбургской и Челябинской областях, а также в Средней Азии. Носительницы этой фамилии — потомки тех самых «избранных», чьи предки носили почетное имя, а сама фамилия остается живым напоминанием о многовековой связи тюркской и славянской культур.