Фамилия Мустафина образована от арабского имени Мустафа, что значит “единственный, избранный”. Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Мустафиных можно лишь на основании генеалогических исследований.