Фамилия Мустыгина — женская форма фамилии Мустыгин, и её разговорный вариант, скорее всего, звучал как Мустыгин. Вглядимся в основу: «мустыг-». Это не очевидный корень, искать в ней что-то «мусти» или «муст» напрямую не стоит. Фамилия явно происходит от прозвища или имени, которое в исходной форме звучало как Мустыга. В русской ономастике суффикс «-ыг-» — редкий, но показательный. Он характерен для северных и северо-западных говоров, особенно для новгородско-псковского региона, где такие суффиксы образовывали прозвища от глаголов или прилагательных (ср. «брызгать» → Брызга, «шевелить» → Шевелыга). Скорее всего, прозвище Мустыга дали человеку с заметной чертой: например, неугомонному, суетливому, тому, кто постоянно «мустится» — в диалектах это слово означало «медлить, мешкать, возиться с чем-то без толку». Второй, менее вероятный вариант — связь с финно-угорским субстратом: в карельском и вепсском языках есть корни, означающие «черный, темный» (ср. musta), и прозвище могли дать по цвету волос или одежды. Но учитывая, что фамилия фиксируется преимущественно в центральных и северных областях России (по данным переписей — единичные случаи в Вологодской, Кировской областях), версия с русским диалектным глаголом выглядит убедительнее. Фамилия не относится к дворянским или купеческим — её носители, скорее всего, крестьяне или посадские люди, получившие прозвище по характеру или роду занятий, связанному с неторопливой, кропотливой работой.