Фамилия Мусяева — женская форма от Мусяев, и её ключ к разгадке лежит не в географии или сословии, а в личном имени. В основе фамилии лежит имя Муся — уменьшительная, домашняя форма от целого ряда крестильных имён. Чаще всего это Матвей (в народном произношении Матфей), Моисей или Мстислав. В быту, особенно в крестьянской и мещанской среде XIX века, такие сокращения были нормой: человека звали не полным именем, а ласковым прозвищем, которое затем закреплялось за его детьми.

Словообразовательная модель здесь самая распространённая для русских фамилий: суффикс -ев (вариант -ов после мягкого согласного) указывает на принадлежность. Мусяев — буквально «сын Муси». А поскольку гласная «я» в окончании выдает женскую форму, то Мусяева — это «дочь» или «жена» Мусяева.

Интересная деталь: фамилия редкая, и её написание может вводить в заблуждение. Ударение, скорее всего, падает на второй слог — Муся́ева, хотя в разговорной речи нередко смещается на первый. Встречается она преимущественно в регионах с сильным влиянием русской ономастической традиции: в Поволжье, на Урале и в Сибири, куда переселенцы принесли свои прозвищные фамилии.

Если рассматривать альтернативную версию, можно предположить тюркские корни: в ряде тюркских языков есть слово «муся» или «муса» с разными значениями (например, «собственность» или имя пророка Моисея в исламе). Однако для фамилии Мусяева, зафиксированной в русской среде, объяснение через русское уменьшительное имя Муся — самое прямое и непротиворечивое. Предки носителей этой фамилии были, скорее всего, простыми людьми, которых в быту звали ласково — Муся, и это прозвище стало родовым.