Фамилия Мыньков образована по одной из самых распространённых в русской ономастике моделей: основа + суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?»). В центре фамилии — прозвище или нецерковное имя Мынько. Суффикс -к-о в данном случае типичен для украинской, белорусской и южнорусской традиции: он уменьшительный или ласкательный, часто переходил в фамилии без дополнительных изменений. То есть Мынько — это человек, которого так называли в быту, а его потомки стали Мыньковыми.

Корень мынь- вызывает споры. Самая прямая и правдоподобная версия связывает его с диалектным глаголом «мынять» — менять, обменивать. В северных и сибирских говорах «мыня» или «мынь» означало менялу, торговца, который занимался обменом товаров. В условиях натурального хозяйства меняла был заметной фигурой на ярмарках и базарах, и такое прозвище легко закреплялось за человеком. Альтернативная версия — от слова «мын» в значении «мельница» (из финно-угорских языков), но она менее вероятна для русской фамильной модели и не имеет широкого подтверждения в источниках.

Географически фамилия Мыньков встречается преимущественно в центральных и южных областях России, а также в Беларуси. Это косвенно подтверждает украинско-белорусское происхождение суффикса -ко: в XIX веке многие носители таких фамилий переселялись из Малороссии и западных губерний в чернозёмные районы и на Дон. В переписных книгах и ревизских сказках XVIII–XIX веков фамилия фиксируется в Курской, Воронежской, Харьковской губерниях.

Интересная деталь: фамилия Мыньков — редкий случай, когда основа сохранила древнюю диалектную лексику, почти исчезнувшую из современного языка. В отличие от фамилий на -менов (Менов, Менщиков), где корень «мена» понятен каждому, форма «мынь» осталась только в говорах. Поэтому носитель фамилии Мыньков, сам того не зная, носит отпечаток старого торгового оборота, который был повседневностью для его предка-менялы.

С точки зрения словообразования фамилия прозрачна: Мыньк(о) + ов. Никаких дополнительных суффиксов, усложняющих чтение, нет. Ударение, скорее всего, падает на первый слог — Мы́ньков, хотя в некоторых говорах возможен вариант Мынько́в (по аналогии с украинскими фамилиями). Точных данных о сословной принадлежности нет: менялой мог быть как крестьянин, так и мещанин, но в любом случае это занятие относилось к числу недворянских, «чёрных» профессий.