Фамилия Нафигина — женская форма фамилии Нафигин, и её разбор стоит начать с конца: суффикс -ин указывает на принадлежность. В русской ономастике фамилии на -ин образуются от основ, оканчивающихся на -а или -я. То есть Нафигин — это «чей?» — сын или потомок человека по прозвищу или имени Нафига.

Самое интересное — основа «Нафиг-». В русском языке слово «нафиг» — это просторечная форма наречия «зачем», «для чего», возникшая из сращения предлога «на» и существительного «фиг» (в значении «ничто», «отказ»). Однако маловероятно, чтобы фамилия образовалась от этого слова напрямую: в XVI–XVII веках, когда складывались основные русские фамилии, такого оборота ещё не было в ходу, а если и был, он едва ли стал бы основой для прозвища. Скорее всего, здесь мы имеем дело с искажением или диалектной формой другого имени.

Есть две правдоподобные версии. Первая: Нафигин могло произойти от тюркского имени Нафиг (арабского корня, означающего «полезный», «выгодный»). В татарской и башкирской среде такие имена встречаются, а суффикс -ин в русских фамилиях нередко появлялся при русификации нерусских фамилий (сравните: Ахметов — Ахметин, хотя это реже). Вторая версия: основа — диалектное слово «нафига» в значении «непоседа» или «бестолковый человек» (от глагола «фигачить» — делать что-то неаккуратно, или от «фига» как жеста). В этом случае прозвище Нафига могли дать человеку с неугомонным или взбалмошным характером.

Географически фамилия Нафигина редкая. По данным открытых источников, она встречается в основном в Поволжье — в Татарстане, Башкортостане, а также в Оренбургской области. Это поддерживает тюркскую версию: в этих регионах исторически жили татары и башкиры, чьи имена и прозвища адаптировались в русскую фамильную модель. Суффикс -ин здесь не случаен: он мог закрепиться при записи в метрические книги русскими писцами, которые переделывали окончание на привычный лад.

Таким образом, предок носительницы фамилии Нафигина — скорее всего, человек по имени Нафиг (тюркское, арабское) либо обладатель прозвища Нафига (диалектное русское). Второй вариант менее вероятен из-за редкости и разговорного оттенка, но полностью исключать его нельзя, особенно если фамилия фиксируется в чисто русских селениях вне тюркского ареала.