Фамилия Нагалисов — редкая и неочевидная с точки зрения корня. Её основа «Нагалис» заставляет задуматься: это искажённое имя, географическое название или прозвище? Скорее всего, перед нами пример фамилии, образованной от прозвища или имени через суффикс -ов, что типично для русских фамилий, указывающих на принадлежность («чей?» — Нагалисов сын). Но что такое «Нагалис»?

Наиболее вероятная версия — связь с тюркским или арабским именем Нагали (или Нагалий). В тюркских языках корень «нага» может означать «дед», «предок» или быть частью сложных имён. Встречается также имя Нагали (Нагалий) у народов Северного Кавказа и Поволжья, которое могло попасть в русскую среду через крещение или соседские контакты. Суффикс -ис в русских фамилиях нетипичен для исконных основ, но мог возникнуть как русификация тюркского окончания (например, «Нагали» + -с для благозвучия) или как описка/фонетическое изменение более привычного «Нагалин» или «Нагалев». В таком случае фамилия Нагалисов — это «сын Нагали».

Другая, менее вероятная версия — от географического названия. В Литве и Беларуси есть топонимы, напоминающие «Нагалис» (например, деревня Нагалишки), но фамилия с таким окончанием скорее указывает на польско-литовское влияние, где суффикс -ис характерен для фамилий (ср. Норкус, Буткус). Однако в русском контексте она могла быть адаптирована через добавление -ов, что превратило бы её в «Нагалисов» — выходец из местности Нагалис.

Поскольку фамилия крайне редкая, её носители, скорее всего, происходят из одного рода или небольшой локальной группы. В дореволюционных источниках она не фиксируется среди дворянства или известных купеческих династий. Предки Нагалисовых могли быть крестьянами или мещанами, получившими фамилию по имени отца или по месту жительства. Географически её стоит искать на юге России, в Поволжье или в регионах с тюркским населением, где такие имена не были редкостью.