Фамилия Небожынский — редкий случай, когда основа почти наверняка указывает на географическое происхождение, а не на личное прозвище или профессию. Её ядро — «Небожын» (или «Небожин»), название населённого пункта. Типичный суффикс -ский/-цкий в польской и западнорусской ономастике закреплял за человеком прозвище по месту жительства: «тот, кто из Небожина». Такой способ образования фамилий был особенно распространён среди шляхты и духовенства, но со временем стал массовым.

Самая вероятная географическая привязка — село Небожин (Nieborzyn) на территории современной Польши, в Мазовецком воеводстве. В исторических документах упоминается также местечко Небожино в бывшей Витебской губернии. Оба варианта укладываются в ареал бытования фамилий на -ский, характерный для земель Речи Посполитой. Носитель фамилии, скорее всего, происходил из мелкопоместной шляхты или зажиточных крестьян, которые получили фамилию при переходе на постоянные прозвища в XVI–XVII веках.

Обратите внимание на написание через «ы» — Небожынский, а не Небожинский. Это не ошибка, а точная передача твёрдого польского «y» в русской транскрипции. В польском оригинале фамилия звучала бы как Nieborzyński (от Nieborzyn), но при переходе в русскую среду «р» могло замениться на «ж» под влиянием местных говоров. Альтернативная, но менее убедительная версия связывает основу с личным именем Небожа (от «не божий» — человек, не признающий Бога, или, наоборот, данный Богом), но тогда фамилия должна была бы звучать как Небожин или Небожов, а не Небожынский.

Встречаемость фамилии крайне низкая. В современных базах данных она фиксируется в основном в западных областях России, Беларуси и на востоке Польши. Это говорит о том, что род не разветвился широко и, вероятно, сохранил локальную привязку к исходному региону. Никаких сведений о массовом переселении или дворянских гербах под этой фамилией нет — перед нами типичный случай «гнездовой» фамилии, которая так и осталась привязанной к одному месту.