Фамилия Небожин — редкий пример того, как ласковое обращение закрепилось в родовом имени. В её основе лежит мирское имя Небожа. В старину словом «небожа» старшие называли младших — чаще всего племянников или племянниц, и звучало оно тепло, по-родственному, примерно как современное «бедняжка» или «милый». Такие имена-отношения были обычным делом: долгожданного ребёнка нарекали Ждан, любимого — Любим или Миляй, а родившегося неожиданно, «нечаянно», — Нечай. В этот же ряд встаёт и Небожа.

Менее вероятно, что в основе лежит прозвище, связанное со словом «небожно», то есть «без божбы, не божась». Тогда Небожей могли прозвать человека нерелигиозного, не клянущегося именем Бога. Но эта версия проигрывает первой: суффикс -ин в фамилии указывает на притяжательное значение «чей?» — «сын Небожи», а ласковые имена в старину встречались куда чаще, чем прозвища, построенные на отрицании.

Сама фамилия образована по простой модели: к основе Небож- добавили суффикс -ин, который в русских фамилиях отвечал на вопрос «чей ты будешь?». Так потомки человека по имени Небожа со временем стали Небожиными. Подобные фамилии на -ин чаще встречались в северных и центральных русских говорах, где мирские имена держались дольше всего, хотя точную географию бытования именно этой фамилии проследить сложно — она остаётся довольно редкой.

Интересно, что фамилия сохранила в себе не только имя, но и оттенок того отношения, с которым предки обращались к своему ребёнку. Это не прозвище по ремеслу и не указание на место жительства, а слепок семейной нежности, застывший в официальном родовом имени.