Фамилия Небожина хранит в себе редкое мирское имя Небожа, которое в старину использовали как ласковое обращение старшего к младшему, а также к племяннику или племяннице. Подобные имена-отношения были обычным делом на Руси: долгожданного ребенка называли Ждан, любимого — Любим или Миляй, а родившегося неожиданно — Нечай. В этот же ряд встает и Небожа — имя, отражающее теплое, заботливое чувство родителей или родственников. Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: Небожина — это «дочь или жена Небожи», то есть прямая наследница человека с этим именем.

Существует и другая, менее вероятная версия происхождения. Она связывает основу со словом «небожно», то есть «без божбы, не божась». В этом случае Небожей могли прозвать человека нерелигиозного, не привыкшего клясться именем Бога. Однако эта гипотеза выглядит натянутой: слишком уж распространены были в древнерусской традиции имена, выражающие родственные чувства, и слишком редко прозвища строились на отрицании религиозных практик. К тому же обращение «небожа» встречается в памятниках народной речи именно как ласкательное, что делает первую версию куда более убедительной.

Интересно, что фамилия сохранила архаичную форму: ударение в ней падает на второй слог, что тоже выдает ее северорусское или сибирское происхождение, где подобные мирские имена держались дольше всего. Сегодня Небожины встречаются редко, и каждая такая семья — живой отголосок той эпохи, когда имя было не просто меткой, а целым высказыванием о том, как человека любят и как его видят близкие.