Фамилия Нечукин образована от прозвища Нечука. Основа здесь — прилагательное «чукавый», то есть «сметливый, догадливый, хитрый» или «пригожий», с отрицательной приставкой «не». Получается, что Нечукой в старину могли называть человека простого и бесхитростного, лишённого той самой хитрецы или внешней приглядности. Впрочем, тут есть и вторая, не менее интересная версия: такое имя могло выполнять охранительную функцию. Родители, желая уберечь сына от сглаза и злых сил, нарекали его Нечукой, надеясь, что он вырастет смекалистым и умным, а имя-оберег отведёт от него беду. В этом случае прозвище работало как оберег, а не как насмешка.

Сама фамилия образована по простой и распространённой модели: к основе Нечук- добавили суффикс -ин, который указывает на принадлежность. То есть Нечукин — это «сын Нечуки», потомок человека с таким прозвищем. Такая схема типична для русских фамилий, образованных от личных имён и прозвищ, оканчивающихся на гласный или мягкий согласный.

Стоит отметить, что корень «чук» в южнорусских говорах встречается и в других словах, связанных со сметливостью и проворством, что делает версию о «хитром» значении довольно убедительной. Однако точное время и место возникновения фамилии назвать сложно. Процесс закрепления прозвища за родом был длительным, и разные ветви рода могли получить фамилию независимо друг от друга в разных местностях. Окончательно говорить о происхождении конкретной семьи Нечукиных можно лишь после серьёзных генеалогических изысканий, но само прозвище, лёгшее в основу фамилии, — яркий образец народной наблюдательности и живого славянского языка.