Фамилия Недюдин — один из тех случаев, когда прозвище-отрицание застыло в фамилии, но его первоначальный смысл неочевиден. Основа здесь — «Недюда», и чтобы понять её, нужно отбросить поверхностное созвучие с «люди» и обратиться к старым русским говорам и личным именам.

Самая вероятная версия: в основе лежит неканоническое имя или прозвище Недюд, которое образовано по типичной модели с приставкой не- (ср. Нелюб, Некрас, Нечай). «Дюд» — древнерусская форма имени Давид, распространённая в народной среде: от «Дюда» до «Дюдя». Соответственно, Недюд — тот, кто не является Дюдом (Давидом). Это могло быть охранительное имя, которое давали ребёнку, чтобы обмануть злых духов: «он не тот, кого вы ищете, он не Дюд». Подобная практика была широко распространена в средневековой Руси, и фамилии на Не- (Нефёдов, Некрасов) — тому подтверждение.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей сын?» — Недюдин. Значит, предок носителя фамилии — человек по прозвищу Недюда, где конечное -а — это типичный для русских прозвищ показатель мужского рода (как в «Михайла», «Кузьма»). В документах XVII века встречаются крестьяне с именем Недюда, что подтверждает реальность такой модели.

Менее убедительна версия, связывающая фамилию с диалектным глаголом «дюдить» (капризничать, дуться). Тогда «недюда» — человек, который не дуется, не капризничает, то есть спокойный. Но эта гипотеза слабее, так как не объясняет устойчивой связи с именем Давид и отсутствия широкого бытования такого диалектного значения.

Фамилия редкая, её география не позволяет выделить один регион — носители разбросаны по центральной России и Поволжью. В дворянских родословных Недюдины не значатся: скорее всего, это крестьянская или мещанская фамилия, закрепившаяся за одной-двумя семьями в конкретной местности и не давшая массового распространения.

Таким образом, Недюдин — это «сын Недюды», а сам Недюда — человек с охранительным именем, которое буквально значило «не Давид».