Фамилия Негоднов звучит нелестно, но её происхождение не связано с отрицательной характеристикой человека. В основе лежит древнерусское некалендарное имя Негодяй. В XV–XVII веках так называли не «плохого человека», а младенца, родившегося «не в год» — то есть не ко времени, нежданно или слишком рано. Имя-оберег должно было отвести от ребёнка злые силы: считалось, что если назвать дитя Негодяем, оно вырастет удачливым и «годным».

Модель образования типична для русских фамилий: суффикс -ов присоединился к основе Негодн- (усечённый вариант от Негодяй). Получилось Негоднов — буквально «сын Негодного» или «потомок Негодяя». В старых документах встречаются варианты Негоднов и Негодяев; первая форма закрепилась благодаря тому, что в бытовой речи имя сократили до Негодный.

Фамилия встречается преимущественно в центральных и южных регионах России — в Тульской, Рязанской, Воронежской областях. В переписных книгах XVI–XVII веков фиксировались крестьяне и посадские люди с этим именем. Дворянских родов Негодновых не известно — фамилия оставалась в простонародной среде, что подтверждает её прозвищное, а не служебное происхождение.

С точки зрения словообразования фамилия любопытна тем, что сохранила архаичную форму имени, которая впоследствии приобрела резко отрицательное значение. В современном русском языке слово «негодяй» стало ругательством, но для носителя фамилии Негоднов это лишь отголосок древней обережной традиции.