Фамилия Нектерова — женская форма фамилии Нектеров, которая образована по довольно редкой модели. В отличие от большинства русских фамилий на -ов/-ев, которые происходят от отчеств (чей сын? — Петров, Иванов), Нектеров восходит к прозвищу, а не к крестильному имени. Основа «Нектер» — это искажённое, народное произношение слова «нектар». В русских говорах, особенно в южных и центральных областях, заимствованные книжные слова часто упрощались: «нектар» превращалось в «нектер», как «трактор» могло стать «трахтер» или «рахтер».

Кто мог получить такое прозвище? Самая вероятная версия — насмешливое прозвище человека, который любил сладкое, лакомства, «нектар» в переносном смысле. В крестьянской среде XVIII–XIX веков «нектаром» могли иронично называть не только мёд или варенье, но и любую сладкую жидкость, вплоть до браги или самогона. Соответственно, Нектером (или Нектерей) могли прозвать сладкоежку, пасечника, либо, наоборот, горького пьяницу — с обратной иронией. Вторая, менее распространённая гипотеза: прозвище Нектер могло быть дано человеку с приторно-сладкой, льстивой речью, «медовым голосом».

Суффикс -ов указывает, что фамилия закрепилась в центральной России, в зоне московских говоров. Географически фамилия Нектеров (и Нектерова) встречается редко, в основном в документах по Курской, Воронежской и Тамбовской губерниям — в тех местах, где акающее произношение и народная этимология особенно активно меняли заимствованные слова. В отличие от фамилии Нектаров (от полной формы «нектар»), вариант с «е» — более простонародный, «обкатанный» языком.

В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) эта фамилия не фигурирует как отдельная статья, что подтверждает её редкость и локальный характер. Носительницы фамилии Нектерова, скорее всего, происходят из однодворческих семей или бывших государственных крестьян юга России, где прозвища давались по бытовым особенностям, а не по профессии.