Фамилия Нектеров — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. На первый взгляд кажется, что в основе лежит слово «некто» («кто-то», «неизвестный»), но в русской традиции фамилий от местоимений почти не образовывали. Поэтому версия с «некто» — самая слабая и маловероятная, её приводят разве что в любительских догадках.

Гораздо надёжнее искать корень в диалектном или профессиональном прозвище. В южнорусских и украинских говорах встречается слово «нектер» — вариант слова «нектар» (сладкий сок цветов, напиток богов). Однако маловероятно, чтобы человека в быту так называли — слишком книжно. Куда правдоподобнее, что перед нами искажённое «нехтерь» или «нектерь» — так в некоторых регионах называли нерасторопного, вялого человека (от «нехт» — никчёмный, никудышный). Прозвище Нектерь давали медлительному или ленивому крестьянину, а его потомки стали Нектеровыми.

По словообразовательной модели фамилия типична для центральной России: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?» — сын Нектера). Ударение, скорее всего, падает на первый слог: Не́ктеров. Встречается она крайне редко, в основном в документах XIX–XX веков из Курской и Воронежской губерний — как раз в зоне бытования южнорусских говоров, где «нектерь» могло быть в ходу.

Сравните с однокоренными, но более частыми фамилиями: Некрасов (от «некрасивый»), Нехорошев (от «нехороший»). Нектеров стоит в том же ряду «отрицательных» прозвищ, но его основа почти исчезла из языка. Если ваш предок носил такую фамилию, он, скорее всего, происходил из крестьянской среды чернозёмной полосы, а прозвище дали за характер или манеру работать — не в обиду, а для отличия среди односельчан.