Фамилия Несенко — украинская по модели образования, что сразу видно по суффиксу -енко. В украинской ономастике этот суффикс — один из самых частых, он указывал на «сына» или «потомка» человека, чьё имя или прозвище легло в основу. То есть Несенко — буквально «сын Неса» или «маленький Нес». Но кто такой Нес?

Здесь начинается самое интересное. Основа Нес- вряд ли восходит к прямому имени Нес — такого в святцах нет. Скорее всего, это сокращённая, обиходная форма от полного крестильного имени. Какое имя могло дать такое усечение? Самый вероятный кандидат — Арсений. В бытовой речи Арсения могли звать Арсен, Арс, а в некоторых говорах — Нес. Сравните: Евсей → Евс, Евсюта; Матвей → Матюха, Матя. Усечение «Арсений» → «Нес» вполне логично: первый слог отпал, остался корень -нес-. Менее вероятная, но возможная версия — от имени Денис (в просторечии Денис → Ден, Нес). Однако форма Нес для Дениса встречается реже.

Второй путь происхождения — не от имени, а от прозвища. В южнорусских и украинских говорах слово «неса» или «несий» могло означать «несущий», «носильщик» или относиться к человеку, который постоянно что-то несёт, таскает. Прозвище Нес могли дать либо носильщику, либо человеку с характерной походкой или привычкой. Но эта версия менее надёжна: фамилии на -енко в массе своей образованы от имён, а не от прозвищ действия.

Географически фамилия Несенко типична для центральной и левобережной Украины — Черкасской, Полтавской, Сумской областей. В России она встречается, но как результат миграций украинского крестьянства в XVIII–XIX веках, особенно в Слобожанщину и на Кубань.

С точки зрения социального статуса, фамилии на -енко в XVII–XVIII веках были распространены в основном среди казачества и крестьянства, реже — среди мещан. Дворянских родов с такой фамилией практически нет. Поэтому предки современного Несенко с высокой вероятностью были казаками или сельскими жителями, а сама фамилия закрепилась за потомками человека по имени Арсений (в обиходе Нес).