Фамилия Нестерчик образована по характерной для западнорусских и украинских земель модели с уменьшительным суффиксом -чик. В отличие от великорусских фамилий на -ов и -ин, которые передавали принадлежность отцу (чей сын?), фамилии на -чик часто фиксировали прозвище или профессиональное имя в уменьшительной форме — буквально «маленький Нестер» или «сын Нестера».

В основе лежит каноническое имя Нестер — народная форма крестильного имени Нестор. В древнерусском языке имя Нестор произносили и писали как Нестер, и именно этот вариант стал основой для множества фамилий: Нестеров, Нестеренко, Нестерук и, конечно, Нестерчик. Имя Нестор греческого происхождения, означает «вернувшийся домой» или «возвратившийся с победой», но в быту оно давно потеряло связь с исходным значением и воспринималось просто как личное имя.

Сам суффикс -чик в польской, белорусской и украинской ономастике выполнял две функции. Первая — патронимическая (сын Нестера). Вторая — уменьшительно-ласкательная: так могли прозвать младшего в роду или человека невысокого роста, носившего то же имя, что и старший родственник. Поэтому фамилия Нестерчик могла закрепиться за сыном Нестера, за его внуком или за человеком, которого в деревне звали «Нестер-маленький» для отличия от другого Нестера.

Географически фамилия тяготеет к западной части исторической России: чаще всего встречается на территории современной Беларуси, в западных областях Украины (Волынь, Галиция) и в приграничных с ними районах Польши. В Российской империи носители фамилии в основном относились к крестьянскому или мещанскому сословию — дворянских родов с такой фамилией почти не зафиксировано, что типично для фамилий на -чик, возникших в народной среде.

Интересная деталь: в дореволюционных метрических книгах фамилию могли записывать по-разному — Нестерчик, Нестерчык, Нестерщик. Вариант через «ы» (Нестерчык) чаще встречается в польскоязычных или полонизированных записях, а через «и» — в русскоязычных. Это не разные фамилии, а следствие разной орфографической традиции, что стоит учитывать при поиске предков.