Фамилия Несторко происходит от канонического мужского имени Нестор, которое в переводе с греческого означает «вернувшийся домой». Это имя носил, в частности, преподобный Нестор Летописец, автор «Повести временных лет», живший в Киево-Печерском монастыре. Церковь также чтит священномученика Нестора, епископа Магидийского, распятого в Пергаме при императоре Деции, и святого мученика Нестора, который в 306 году с благословения Димитрия Солунского победил в поединке языческого бойца и был за это казнен.

Разбираем словообразовательную модель. Суффикс -ко в фамилии Несторко — типичный для украинской, белорусской и южнорусской традиции. Он выполнял роль уменьшительно-ласкательного или обиходного форманта, превращая полное церковное имя в домашнее прозвище. Так из Нестора получался Несторко — «маленький Нестор» или, скорее, просто «Нестор, сын такого-то». На восточнославянских землях патронимические фамилии на -ко закрепились без дополнительного суффикса принадлежности: если в Великороссии говорили «Несторов сын», то на Украине или в Белоруссии могли сказать просто «Несторко». Поэтому фамилию стоит понимать не как «сын Нестора» в строгом грамматическом смысле, а как прямое указание на отца или на самого человека, носившего уменьшительную форму имени.

Интересно, что фамилия сохранила архаичную форму без падежного окончания, что роднит её с такими же образованиями, как Иванко, Петро, Грицько. В документах Российской империи такие фамилии часто русифицировали, добавляя -ов, но вариант Несторко устоялся как самостоятельный. Географически фамилия тяготеет к западным и юго-западным регионам бывшей Российской империи — современным Украине и Белоруссии, хотя носители могли расселяться и дальше на восток.

Спорных версий происхождения здесь немного. Иногда фамилию пытаются связать с греческим словом «нестор» как обозначением старца или советника, но это вторичное осмысление, а не источник: в основе всё же лежит личное имя, а не нарицательное существительное. Слабой выглядит и гипотеза о связи с тюркскими корнями — она не подтверждается ни фонетикой, ни ареалом бытования фамилии.

Именины Нестора приходятся на несколько дат в церковном календаре, что в прошлом давало возможность крестить так детей в разные сезоны года. В крестьянской среде имя не было редкостью, но и не входило в число самых частых, поэтому фамилия Несторко встречается заметно реже, чем, скажем, Иванов или Петров. Среди носителей фамилии нет громких исторических фигур, известных широкой публике, — это типичная родовая фамилия, которая передавалась по мужской линии и закрепилась за потомками конкретного человека по имени Нестор.