Фамилия Нестюркина — женская форма, её мужской вариант — Нестюркин. С первого взгляда она кажется производной от редкого имени Нестюр, но на деле всё чуть сложнее.

В основе фамилии лежит просторечная или диалектная форма Нестюра — от крестильного имени Нестор (греч. «возвратившийся домой»). В русских говорах имя Нестор переделывали: Нестер, Нестёр, Нестюра. Суффикс -к- в Нестюрка — это не уменьшительно-ласкательный, а скорее уничижительный или бытовой, как в Димка, Ванька. От такого обиходного прозвища Нестюрка и пошла фамилия: «чей?» — Нестюркин, то есть сын или потомок Нестюрки.

Словообразовательная модель простая: основа Нестюрк- + суффикс -ин. Это типичный «патроним» (отчество в форме притяжательного прилагательного), который закрепился как фамилия в центральных и северных губерниях России. В отличие от фамилий на -ов/-ев, -ин чаще встречался в Новгородской, Псковской, Вологодской землях, где активно бытовали краткие формы имён.

Редкая буква «ё» в середине — не случайность. Написание Нестюркина (а не Нестуркина) указывает на северное или северо-западное произношение: в местных говорах «у» после мягкого согласного могло переходить в «ю». Такая орфография — прямое свидетельство живой речи предков.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями: Нестеров, Нестеровский, Несторов — все они от того же Нестора, но Нестюркин стоит особняком. Он передаёт не просто имя, а конкретную бытовую форму, которая могла быть прозвищем человека с каким-то заметным недостатком или просто младшего в семье. Сословная принадлежность носителей — скорее всего, крестьяне или посадские люди, поскольку у дворянских родов такие «простонародные» суффиксы почти не встречались.

Встречаемость фамилии низкая, в современных справочниках она не фиксируется как распространённая. Это значит, что большинство Нестюркиных — потомки одной или нескольких семей из одного региона, скорее всего, из бывших Новгородских или Вятских земель.