Фамилия Незамутдинова — редкий случай, когда арабское имя и русский патронимический суффикс сплавились в почти прозрачную, но обманчиво простую форму. Основа здесь — мужское мусульманское имя Замутдин (варианты: Замуддин, Замаддин), которое восходит к арабскому «зимāм ад-дӣн» — «опора веры» или «поручитель веры». Приставка «не-» в фамилии не имеет отрицательного смысла, как в русских словах «негодяй» или «невежа». Это часть составного антропонима: в тюрко-татарской среде имена с элементом «не» (от персидского «не» — «не») иногда образовывали пары по принципу «не делай того-то» или «не такой, как все», но в данном случае «Незамутдин» — это, скорее всего, фонетическая адаптация варианта «Нежмутдин» (от арабского «наджм» — звезда) или результат сращения частицы «не» с именем Замутдин по аналогии с русскими фамилиями вроде Некрасов.

Фамилия построена по типичной для Поволжья и Приуралья модели: основа мужского имени + суффикс -ов/-ев, который в русской традиции означал принадлежность («чей сын»). Женская форма Незамутдинова указывает, что исходная мужская фамилия — Незамутдинов. Носители фамилии — почти исключительно татары и башкиры, реже — представители других тюркских народов, принявших русскую паспортную систему в XIX — начале XX века. Географически фамилия привязана к Татарстану, Башкортостану, Оренбургской и Челябинской областям — регионам, где исламские имена свободно входили в русскую фамильную форму.

Необычность фамилии в том, что её можно ошибочно прочитать как русскую — от слова «незамутнённый» (чистый, прозрачный). Но это ложная этимология: в фамилии нет суффикса прилагательного, и ударение, скорее всего, падает на последний слог основы (Незамутди́нова). В ономастических словарях фамилия не зафиксирована, что говорит о её низкой частотности и локальном бытовании. Если искать однокоренные параллели, то это Замутдинов, Нежмутдинов, а также фамилии на -динов (Шарафутдинов, Сафиуллин), где та же модель «имя + религия».

Таким образом, предки современной носительницы фамилии — скорее всего, татарские или башкирские крестьяне или ремесленники из деревень Казанской или Уфимской губернии, чьё имя при переписи записали через русское окончание. Фамилия не таит в себе ни загадочной истории, ни знатного происхождения — она честно указывает на имя основателя рода, которое переводится как «опора веры».