Фамилия Низамутдинова ведет свое начало от мусульманского мужского имени Низамутдин, которое в переводе с арабского означает «устройство веры». Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Низамутдиновых можно лишь на основании генеалогических исследований.