Фамилия Нигмадзянов — один из тех случаев, когда русская словообразовательная модель накладывается на арабское имя, и чтобы понять её, нужно разобрать имя-основу. Вопреки возможному предположению, корень здесь не связан с чем-то мрачным или тяжёлым. Всё ровно наоборот.

Основа фамилии — арабское мужское имя Нигмадзян (или Нигмаджан), которое распространено у татар, башкир и других тюркоязычных народов, исповедующих ислам. Имя это составное. Первая часть, «Нигмат» (от араб. ни‘ма — «благо», «благодать», «милость»), вторая — «джан» (персидское جَان, jân — «душа», «жизнь», «дорогой»). В сумме Нигмаджан означает «благодать души», «милостивая душа» или «душа, полная блага». В разговорной речи и при записи в русских документах имя нередко упрощалось до формы Нигмадзян, где «дж» переходило в «дз» — характерная черта фонетической адаптации восточных имён в татарской среде.

Русский суффикс -ов, присоединённый к основе, — классический патронимический показатель, означающий «сын» или «принадлежащий». Таким образом, Нигмадзянов — буквально «сын Нигмадзяна». Фамилия образована по той же модели, что и сотни тысяч других русских фамилий, но с нерусским корнем. Это типичный пример для Поволжья и Приуралья, где в XIX — начале XX века при переписях и паспортизации татарам и башкирам часто оформляли фамилии по русскому образцу: от имени отца с суффиксом -ов или -ин.

Интересная деталь: в отличие от более распространённых татарских фамилий на -ов (например, Абдуллин, Хайруллин), форма Нигмадзянов встречается реже. Причина — в самом имени: оно менее популярно, чем, скажем, Абдулла или Хасан. Кроме того, существует параллельная форма Нигмаджанов, где сохранён исходный звук «дж». Встречаются оба варианта, но Нигмадзянов — это именно та фонетическая запись, которая закрепилась в документах у части носителей, особенно в Башкортостане и Татарстане. Если ваш предок носил эту фамилию, он почти наверняка был из среды волго-уральских татар или башкир, а род его по мужской линии восходит к человеку, которого звали Нигмаджан (или Нигмадзян) — человеку с «благодатной душой».