Фамилия Нигметжанов — одна из тех, что почти не встречаются в центральной России и сразу выдают азиатские корни носителя. Её основа — арабское имя Нигметжан, которое сложилось из двух частей: «нигмат» (от араб. نعمة — «благо», «милость», «благодать») и персидского «жан» (جان — «душа», «жизнь»). Вместе это значит «душа-благодать» или «милость жизни». Такие составные имена были очень популярны у татар, башкир и народов Средней Азии, особенно в XIX — начале XX века.

Фамилия образована по классической русской модели: к имени Нигметжан добавили суффикс -ов, который указывает на принадлежность («чей?» — Нигметжанов). То есть буквально — «потомок Нигметжана». Такой способ русификации фамилий был массовым у тюркских народов после вхождения их земель в состав Российской империи: местные имена адаптировали под русскую грамматику, добавляя стандартные патронимические суффиксы.

Сложно сказать, из какого именно региона происходит конкретная ветвь Нигметжановых, но фамилия устойчиво фиксируется у казанских татар, а также у башкир и казахов. В метрических книгах и ревизских сказках XIX века она почти не встречается — это говорит о том, что фамилия либо поздняя (оформилась уже после отмены крепостного права), либо изначально бытовала в устной форме и была записана советскими паспортистами.

Интересная деталь: в татарской среде имя Нигметжан часто давали мальчикам, родившимся после долгого бесплодия или в трудный для семьи период — как просьбу о «благе жизни». Поэтому фамилия Нигметжанов может указывать на то, что предок был долгожданным и ценным ребёнком. Другие однокоренные фамилии — Нигматуллин, Нигметов, Нигматзянов — образованы от тех же корней, но с разными суффиксами и окончаниями, и все они восходят к тому же арабскому «нигмат».